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上海士鋒生物科技有限公司
中級(jí)會(huì)員 | 第14年

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標(biāo)準(zhǔn)品
培養(yǎng)基
培養(yǎng)基原料 霍亂弧菌診斷血清 大腸艾希氏菌診斷血清 志賀氏菌屬診斷血清 沙門氏菌屬診斷血清 標(biāo)準(zhǔn)血清,診斷血清 抗生素藥敏紙片 微生物配套試劑 微生物生化管 管裝培養(yǎng)基 即用型液體培養(yǎng)基 一次性培養(yǎng)基平板 顯色培養(yǎng)基 臨床培養(yǎng)基 菌種保存培養(yǎng)基 四環(huán)素檢定、厭氧亞硫酸鹽還原桿菌檢測(cè)培養(yǎng)基 維生素檢測(cè)培養(yǎng)基 一次性衛(wèi)生用品衛(wèi)生檢測(cè)培養(yǎng)基 罐頭食品商業(yè)無菌檢測(cè)培養(yǎng)基 飲用水及水源檢測(cè)培養(yǎng)基 藥品、生物制品檢測(cè)培養(yǎng)基 化妝品檢測(cè)培養(yǎng)基 動(dòng)物細(xì)胞培養(yǎng)基 啤酒檢驗(yàn)培養(yǎng)基 軍團(tuán)菌檢測(cè)培養(yǎng)基 支原體檢測(cè)培養(yǎng)基 小腸結(jié)腸炎耶爾森氏菌檢驗(yàn)培養(yǎng)基 彎曲桿菌檢驗(yàn)培養(yǎng)基 產(chǎn)氣莢膜梭菌、肉毒梭菌、厭氧菌檢驗(yàn)培養(yǎng)基 阪崎腸桿菌檢驗(yàn)培養(yǎng)基 溶血性鏈球菌檢測(cè)培養(yǎng)基 李斯特氏菌檢測(cè)培養(yǎng)基 弧菌檢測(cè)培養(yǎng)基 乳酸菌、雙歧桿菌檢測(cè)培養(yǎng)基 酵母、霉菌檢測(cè)培養(yǎng)基 檢測(cè)培養(yǎng)基 沙門氏菌、志賀氏菌檢驗(yàn)培養(yǎng)基 大腸菌群、糞大腸菌群、大腸桿菌及腸桿菌科檢測(cè)培養(yǎng)基 細(xì)菌總數(shù)檢測(cè),增菌培養(yǎng)基
抗體
生物試劑
細(xì)胞
菌株
血清
細(xì)胞分離試劑
試劑盒

上海士鋒關(guān)于DNA的生物活性與功能介紹

時(shí)間:2013/5/10閱讀:959
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DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)

7個(gè)月后,這一爭(zhēng)論還沒有平息。一些學(xué)術(shù)期刊和無數(shù)的博客針對(duì)這個(gè)話題發(fā)表觀點(diǎn)。在4月8號(hào),Ceurrent Biology雜志發(fā)表了關(guān)于該話題的第二篇文章,這一現(xiàn)象讓人不得不感到好奇,為什么“功能”這個(gè)簡(jiǎn)單的詞語能引起如此大的分歧呢?

Encode項(xiàng)目是由美國(guó)NIH的國(guó)家人類基因組研究所(National Human Genome Research Institute)贊助,目的是對(duì)在人類基因組項(xiàng)目中產(chǎn)生的數(shù)據(jù)進(jìn)行分析處理。不同的基因編碼了各種特定蛋白質(zhì),完成了細(xì)胞中的大部分功能,但這僅僅是少部分的基因,對(duì)于基因組中大部分序列的作用,科學(xué)家們并不知道。

因此,Encode項(xiàng)目幾乎分析了基因組中所有部分——尤其是其中不編碼蛋白質(zhì)的98%,希望能夠找到有關(guān)它們?cè)谌梭w中作用的相關(guān)線索。這些工作非常重要,因?yàn)榭茖W(xué)家們確信這98%中有些部分作為調(diào)節(jié)元件,指導(dǎo)了蛋白質(zhì)何時(shí)何地,以多大量合成。這一工作對(duì)于了解正常細(xì)胞行為非常關(guān)鍵,然而科學(xué)家目前也僅僅了解少數(shù)個(gè)例。他們不知道是否存在比目前已知數(shù)量更多的調(diào)節(jié)元件,也不知道如果確實(shí)如此的話,它們又是如何發(fā)揮作用的。這些調(diào)節(jié)區(qū)域可能有助于解釋某些與遺傳相關(guān),但是又與特定編碼基因無直接關(guān)聯(lián)的疾病的基礎(chǔ)。

在2012年9月,Encode項(xiàng)目的主要研究階段正式結(jié)束。研究者們發(fā)表了幾十篇同行評(píng)審的文章,其中發(fā)表在Nature雜志上的論文稱,人類基因組中80%的序列是具有功能的。同時(shí)研究者們還公開了數(shù)據(jù)庫(kù),這個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)大部分非編碼序列進(jìn)行了注釋。注釋方式基本上就是這樣:“這部分序列與一種蛋白質(zhì)結(jié)合”,“這部分序列常被甲基基團(tuán)標(biāo)記”,“這部分序列通常隱藏在組蛋白的包圍中”。

而對(duì)于Encode項(xiàng)目的批評(píng)大部分并不是針對(duì)其所構(gòu)建的數(shù)據(jù)庫(kù)。牛津大學(xué)的遺傳學(xué)研究專家Chris Ponting說道,“Encode項(xiàng)目為科學(xué)界提供了大量有用的數(shù)據(jù),這些數(shù)據(jù)正在用于的研究中。”但Chris Ponting并不贊同Encode項(xiàng)目有關(guān)功能性DNA的結(jié)論。實(shí)際上,主要的批評(píng)針對(duì)的是項(xiàng)目研究者在結(jié)論上的“大躍進(jìn)”,尤其是他們公開發(fā)表稱人類基因組中大部分序列是人類生命所必需的。批評(píng)意見認(rèn)為,Encode項(xiàng)目的工作并不能支持這樣的結(jié)論,向公眾傳達(dá)了不準(zhǔn)確的有關(guān)遺傳與進(jìn)化的觀念。

產(chǎn)生這些分歧的關(guān)鍵在于,Encode在DNA中發(fā)現(xiàn)了具有化學(xué)活性的部分,并稱其具有“功能”。但是,并非所有的這類活性都是人類生命所必需的。例如,Encode的科學(xué)家尋找與蛋白質(zhì)結(jié)合的DNA區(qū)域,因?yàn)檫@類結(jié)合對(duì)于打開、閱讀以及標(biāo)記DNA是必須的。但是有的DNA序列也可以結(jié)合蛋白質(zhì),但是卻與人類健康無關(guān)。在漫長(zhǎng)的進(jìn)化過程中,人類的基因組中吸納了許多來自病毒的DNA。那些不會(huì)危害或者協(xié)助宿主的DNA序列可能仍然包含有可與蛋白質(zhì)結(jié)合的區(qū)域,或者發(fā)揮某些功能,但是并不影響細(xì)胞正常功能。

Encode項(xiàng)目不可避免地將一些可能對(duì)人體并無重要作用的區(qū)域當(dāng)作活躍的功能區(qū)域。不過,Stamatoyannopoulos博士和其他的生物學(xué)家認(rèn)為,Encode項(xiàng)目的80%的結(jié)論帶來了有關(guān)人類基因組的新視角。他說,人類基因組中如此高比例具有生物化學(xué)活性的事實(shí)說明,人類基因組中受到調(diào)控的序列比以前了解到的要多得多。甚至某些來自于病毒或者其他寄生生物的序列可能在人體中發(fā)揮有用的功能。西奈山醫(yī)學(xué)院的遺傳學(xué)家Eric Schadt (未參與該項(xiàng)目)說:“我認(rèn)為這種調(diào)節(jié)網(wǎng)絡(luò)的復(fù)雜性將持續(xù)拓展我們的思維。我想我們會(huì)發(fā)現(xiàn),基因組中的大多數(shù)序列在調(diào)節(jié)中發(fā)揮作用。”

批評(píng)意見強(qiáng)調(diào),Encode項(xiàng)目并不是為了研究基因組中有多少非編碼序列在人類健康中發(fā)揮了重要作用。他們認(rèn)為,Encode項(xiàng)目并沒有通過實(shí)驗(yàn)證實(shí)那些新發(fā)現(xiàn)的“功能”區(qū)域如何對(duì)人體產(chǎn)生影響,因而獲得了多么新穎而具革命性的成果的這種說法是站不住腳的。

Encode項(xiàng)目的人士將人類基因組描述為其中大部分序列可被有效利用,但批評(píng)人士認(rèn)為這不是正確的看待基因組的方式。“人類基因組是一臺(tái)的機(jī)器嗎?人類基因組是所有基因組中的嗎?或者它只是一團(tuán)糟?搞清這些問題非常重要,”幫助設(shè)計(jì)Encode項(xiàng)目的遺傳學(xué)家Sean Eddy說。“我們對(duì)基因組的認(rèn)識(shí)是,它確實(shí)是一團(tuán)糟。”

對(duì)于“一團(tuán)糟”,Eddy指的是從進(jìn)化的數(shù)學(xué)模型得出的結(jié)論:基因組中至少有85%質(zhì)90%的序列對(duì)人類健康不是必須的,即便它們具有化學(xué)活性。這么說的部分理由是,人類基因組在漫長(zhǎng)歷史中積累了無數(shù)的突變,如果基因組中大多數(shù)序列是必須的,那么人類早就因?yàn)檫@些突變對(duì)健康的影響而滅絕了。另一方面,Stamatoyannopoulos博士和Schadt也表示,那些數(shù)學(xué)模型是基于1960年代的一些簡(jiǎn)單方程而建立的,可能具有某些數(shù)值上的錯(cuò)誤。Eddy說,那是有可能的,但是科學(xué)家在貶低這些模型前應(yīng)該先找到更好的論據(jù)來駁倒它們

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